Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabrg1Q9R0Y8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabrg1Q9R0Y8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabrg1Q9R0Y8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrg1Q9R0Y8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrg1Q9R0Y8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrg1Q9R0Y8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabrg1Q9R0Y8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms