Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmx1aQ9JKU8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmx1aQ9JKU8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmx1aQ9JKU8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmx1aQ9JKU8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmx1aQ9JKU8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmx1aQ9JKU8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmx1aQ9JKU8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmx1aQ9JKU8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms