Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cngb3Q9JJZ9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cngb3Q9JJZ9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cngb3Q9JJZ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cngb3Q9JJZ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cngb3Q9JJZ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cngb3Q9JJZ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cngb3Q9JJZ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cngb3Q9JJZ9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cngb3Q9JJZ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cngb3Q9JJZ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cngb3Q9JJZ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cngb3Q9JJZ9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cngb3Q9JJZ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cngb3Q9JJZ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cngb3Q9JJZ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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