Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PalldQ9ET54 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PalldQ9ET54 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PalldQ9ET54 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PalldQ9ET54 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PalldQ9ET54 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PalldQ9ET54 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PalldQ9ET54 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PalldQ9ET54 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PalldQ9ET54 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PalldQ9ET54 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PalldQ9ET54 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PalldQ9ET54 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PalldQ9ET54 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PalldQ9ET54 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PalldQ9ET54 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PalldQ9ET54 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PalldQ9ET54 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PalldQ9ET54 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PalldQ9ET54 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms