Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Efhd1Q9D4J1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efhd1Q9D4J1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Efhd1Q9D4J1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efhd1Q9D4J1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175 ms