Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Fsip1Q9D3V5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fsip1Q9D3V5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Fsip1Q9D3V5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fsip1Q9D3V5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fsip1Q9D3V5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fsip1Q9D3V5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fsip1Q9D3V5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms