Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hddc3Q9D114 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hddc3Q9D114 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hddc3Q9D114 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms