Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
Hddc3Q9D114 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Hddc3Q9D114 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Hddc3Q9D114 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Hddc3Q9D114 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Hddc3Q9D114 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Hddc3Q9D114 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Hddc3Q9D114 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Hddc3Q9D114 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Hddc3Q9D114 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hddc3Q9D114 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Hddc3Q9D114 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Hddc3Q9D114 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Hddc3Q9D114 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Hddc3Q9D114 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Hddc3Q9D114 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Hddc3Q9D114 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
Hddc3Q9D114 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Hddc3Q9D114 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Hddc3Q9D114 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Hddc3Q9D114 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Hddc3Q9D114 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Hddc3Q9D114 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Hddc3Q9D114 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Hddc3Q9D114 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Hddc3Q9D114 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Hddc3Q9D114 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Hddc3Q9D114 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Hddc3Q9D114 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Hddc3Q9D114 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Hddc3Q9D114 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Hddc3Q9D114 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Hddc3Q9D114 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Hddc3Q9D114 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Hddc3Q9D114 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Hddc3Q9D114 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Hddc3Q9D114 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Hddc3Q9D114 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Hddc3Q9D114 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Hddc3Q9D114 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Hddc3Q9D114 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Hddc3Q9D114 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Hddc3Q9D114 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hddc3Q9D114 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hddc3Q9D114 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Hddc3Q9D114 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Hddc3Q9D114 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Hddc3Q9D114 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Hddc3Q9D114 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Hddc3Q9D114 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Hddc3Q9D114 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Hddc3Q9D114 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hddc3Q9D114 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hddc3Q9D114 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hddc3Q9D114 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hddc3Q9D114 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Hddc3Q9D114 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hddc3Q9D114 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hddc3Q9D114 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Hddc3Q9D114 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hddc3Q9D114 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hddc3Q9D114 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hddc3Q9D114 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Hddc3Q9D114 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hddc3Q9D114 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hddc3Q9D114 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hddc3Q9D114 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hddc3Q9D114 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hddc3Q9D114 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hddc3Q9D114 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hddc3Q9D114 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Hddc3Q9D114 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hddc3Q9D114 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hddc3Q9D114 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hddc3Q9D114 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Hddc3Q9D114 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hddc3Q9D114 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Hddc3Q9D114 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hddc3Q9D114 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hddc3Q9D114 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hddc3Q9D114 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hddc3Q9D114 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Hddc3Q9D114 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hddc3Q9D114 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hddc3Q9D114 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hddc3Q9D114 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hddc3Q9D114 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hddc3Q9D114 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Hddc3Q9D114 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hddc3Q9D114 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hddc3Q9D114 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hddc3Q9D114 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hddc3Q9D114 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hddc3Q9D114 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Hddc3Q9D114 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hddc3Q9D114 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hddc3Q9D114 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hddc3Q9D114 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hddc3Q9D114 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hddc3Q9D114 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms