Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rnf17Q99MV7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rnf17Q99MV7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rnf17Q99MV7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rnf17Q99MV7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rnf17Q99MV7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rnf17Q99MV7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rnf17Q99MV7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rnf17Q99MV7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rnf17Q99MV7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rnf17Q99MV7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rnf17Q99MV7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms