Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG4

Ttc5, Tetratricopeptide repeat protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc5Q99LG4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttc5Q99LG4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttc5Q99LG4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttc5Q99LG4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc5Q99LG4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc5Q99LG4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc5Q99LG4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ttc5Q99LG4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc5Q99LG4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttc5Q99LG4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc5Q99LG4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc5Q99LG4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc5Q99LG4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc5Q99LG4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc5Q99LG4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc5Q99LG4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc5Q99LG4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc5Q99LG4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc5Q99LG4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc5Q99LG4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc5Q99LG4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc5Q99LG4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttc5Q99LG4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.2 ms