Protein–RNA interactions for Protein: Q99208

YLL066C, Y' element ATP-dependent helicase YLL066C, yeastyeast

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL066CQ99208 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 SUF23tG(GCC)J2 71 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 SUF17tG(GCC)O2 71 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 IRC11YOR013W 471 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 YHK8YHR048W 1545 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 UIP5YKR044W 1332 nt8.57□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 ALR1YOL130W 2580 nt8.56□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 RGD2YFL047W 2145 nt8.56□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 PTC3YBL056W 1407 nt8.56□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 AQR1YNL065W 1761 nt8.55□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 YOR200WYOR200W 399 nt8.55□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 LAS17YOR181W 1902 nt8.54□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 AMN1YBR158W 1650 nt8.54□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 SDH4YDR178W 546 nt8.54□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt8.54□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 IRC7YFR055W 1023 nt8.54□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 VPS24YKL041W 675 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 OGG1YML060W 1131 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 NSG2YNL156C 900 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 YPL102CYPL102C 303 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL066CQ99208 PPH22YDL188C 1134 nt8.52□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 MTR3YGR158C 753 nt8.52□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 PTC4YBR125C 1182 nt8.52□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 DSF1YEL070W 1509 nt8.52□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 YNR073CYNR073C 1509 nt8.52□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 RDN5-2RDN5-2 119 nt8.51□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 RDN5-3RDN5-3 119 nt8.51□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 RDN5-4RDN5-4 119 nt8.51□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 RDN5-5RDN5-5 119 nt8.51□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 RFS1YBR052C 633 nt8.51□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 YGR054WYGR054W 1929 nt8.51□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 ATG36YJL185C 882 nt8.5□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 RPS28AYOR167C 204 nt8.5□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 YJR146WYJR146W 354 nt8.49□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 PSR2YLR019W 1194 nt8.49□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 PRY3YJL078C 2646 nt8.49□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 ARE2YNR019W 1929 nt8.49□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 HVG1YER039C 750 nt8.48□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 SRL2YLR082C 1179 nt8.48□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 COQ3YOL096C 939 nt8.48□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 CTF19YPL018W 1110 nt8.48□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 GGC1YDL198C 903 nt8.48□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 GLC8YMR311C 690 nt8.48□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 MRPL10YNL284C 969 nt8.48□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 YPL257WYPL257W 582 nt8.48□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 CCC2YDR270W 3015 nt8.47□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 DYS1YHR068W 1164 nt8.47□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt8.47□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 YBR241CYBR241C 1467 nt8.46□□□□□ -1.05
YLL066CQ99208 PMA2YPL036W 2844 nt8.46□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 CCT3YJL014W 1605 nt8.45□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 EDE1YBL047C 4146 nt8.45□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 COX10YPL172C 1389 nt8.45□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 LYS21YDL131W 1323 nt8.45□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 FAL1YDR021W 1200 nt8.45□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 MAS1YLR163C 1389 nt8.44□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt8.44□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 LYS1YIR034C 1122 nt8.44□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 RFC4YOL094C 972 nt8.44□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 PEX31YGR004W 1389 nt8.43□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 YLR173WYLR173W 1827 nt8.43□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 GNP1YDR508C 1992 nt8.43□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 DOT5YIL010W 648 nt8.43□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 ARC35YNR035C 1029 nt8.42□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 DFR1YOR236W 636 nt8.42□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 HBN1YCL026C-B 582 nt8.42□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 RTG2YGL252C 1767 nt8.42□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 MOG1YJR074W 657 nt8.41□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 GTO3YMR251W 1101 nt8.41□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 MIP1YOR330C 3765 nt8.41□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 HEM1YDR232W 1647 nt8.4□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt8.4□□□□□ -1.06
YLL066CQ99208 RVB2YPL235W 1416 nt8.4□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 YNL120CYNL120C 486 nt8.39□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 NME1NME1 340 nt8.39□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 OPI11YPR044C 354 nt8.39□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 MCH2YKL221W 1422 nt8.39□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt8.38□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 FPR3YML074C 1236 nt8.38□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 UIP4YPL186C 915 nt8.38□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 SLA2YNL243W 2907 nt8.38□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 PPT1YGR123C 1542 nt8.37□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 IVY1YDR229W 1362 nt8.37□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 GPA2YER020W 1350 nt8.37□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 EMP65YER140W 1671 nt8.36□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 PAC10YGR078C 600 nt8.36□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 KSH1YNL024C-A 219 nt8.36□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 YNR014WYNR014W 639 nt8.36□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 MDE1YJR024C 735 nt8.35□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt8.35□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 RUF23RUF23 254 nt8.35□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 MSY1YPL097W 1479 nt8.35□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 CTF3YLR381W 2202 nt8.35□□□□□ -1.07
YLL066CQ99208 ERG1YGR175C 1491 nt8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 232.7 ms