Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I8

Defb19, Beta-defensin 19, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb19Q8K3I8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Defb19Q8K3I8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Defb19Q8K3I8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Defb19Q8K3I8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Defb19Q8K3I8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms