Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZK6

Trim61, MCG22896, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim61Q8JZK6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim61Q8JZK6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim61Q8JZK6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim61Q8JZK6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim61Q8JZK6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim61Q8JZK6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim61Q8JZK6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim61Q8JZK6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim61Q8JZK6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim61Q8JZK6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim61Q8JZK6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim61Q8JZK6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim61Q8JZK6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim61Q8JZK6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim61Q8JZK6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim61Q8JZK6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim61Q8JZK6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms