Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip10Q8CJ53 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip10Q8CJ53 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip10Q8CJ53 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip10Q8CJ53 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip10Q8CJ53 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip10Q8CJ53 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip10Q8CJ53 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip10Q8CJ53 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip10Q8CJ53 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip10Q8CJ53 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip10Q8CJ53 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip10Q8CJ53 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip10Q8CJ53 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip10Q8CJ53 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms