Protein–RNA interactions for Protein: Q811W2

Cyp26b1, Cytochrome P450 26B1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26b1Q811W2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp26b1Q811W2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp26b1Q811W2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp26b1Q811W2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp26b1Q811W2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp26b1Q811W2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp26b1Q811W2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp26b1Q811W2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp26b1Q811W2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp26b1Q811W2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp26b1Q811W2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp26b1Q811W2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp26b1Q811W2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp26b1Q811W2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp26b1Q811W2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp26b1Q811W2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp26b1Q811W2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26b1Q811W2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26b1Q811W2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26b1Q811W2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26b1Q811W2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26b1Q811W2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26b1Q811W2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26b1Q811W2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26b1Q811W2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms