Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc27Q80YS5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc27Q80YS5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc27Q80YS5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc27Q80YS5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc27Q80YS5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc27Q80YS5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc27Q80YS5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms