Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc6aQ78XR0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc6aQ78XR0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc6aQ78XR0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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