Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf728Q6P5C7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf728Q6P5C7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf728Q6P5C7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf728Q6P5C7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf728Q6P5C7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf728Q6P5C7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf728Q6P5C7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf728Q6P5C7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf728Q6P5C7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf728Q6P5C7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms