Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PrimpolQ6P1E7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PrimpolQ6P1E7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrimpolQ6P1E7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PrimpolQ6P1E7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.2 ms