Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Slx4Q6P1D7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Slx4Q6P1D7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Slx4Q6P1D7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Slx4Q6P1D7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Slx4Q6P1D7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Slx4Q6P1D7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Slx4Q6P1D7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Slx4Q6P1D7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Slx4Q6P1D7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Slx4Q6P1D7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Slx4Q6P1D7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Slx4Q6P1D7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Slx4Q6P1D7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Slx4Q6P1D7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Slx4Q6P1D7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.45■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Slx4Q6P1D7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Slx4Q6P1D7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Slx4Q6P1D7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Slx4Q6P1D7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Slx4Q6P1D7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Slx4Q6P1D7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Slx4Q6P1D7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Slx4Q6P1D7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Slx4Q6P1D7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Slx4Q6P1D7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Slx4Q6P1D7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Slx4Q6P1D7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Slx4Q6P1D7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Slx4Q6P1D7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms