Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc3c1Q6DFV6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fndc3c1Q6DFV6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fndc3c1Q6DFV6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms