Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rftn1Q6A0D4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rftn1Q6A0D4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rftn1Q6A0D4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn1Q6A0D4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms