Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccl12Q62401 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms