Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc85aQ5SP85 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc85aQ5SP85 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85aQ5SP85 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms