Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm11487Q5RIS0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm11487Q5RIS0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm11487Q5RIS0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm11487Q5RIS0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms