Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp48Q3V0C5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp48Q3V0C5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp48Q3V0C5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp48Q3V0C5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms