Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LcorlQ3U285 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LcorlQ3U285 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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