Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 RAB5B-207ENST00000549915 494 ntTSL 43.66□□□□□ -1.829e-8■■■■■ 57.9
PCBP2Q15366 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.452e-11■■■■■ 57.8
PCBP2Q15366 ADGRL2-217ENST00000469377 3151 ntTSL 26.02□□□□□ -1.452e-11■■■■■ 57.8
PCBP2Q15366 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.522e-11■■■■■ 57.8
PCBP2Q15366 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.582e-11■■■■■ 57.8
PCBP2Q15366 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.582e-11■■■■■ 57.8
PCBP2Q15366 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.652e-11■■■■■ 57.8
PCBP2Q15366 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.662e-11■■■■■ 57.8
PCBP2Q15366 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.712e-11■■■■■ 57.8
PCBP2Q15366 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.732e-11■■■■■ 57.8
PCBP2Q15366 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.82e-11■■■■■ 57.8
PCBP2Q15366 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.812e-11■■■■■ 57.8
PCBP2Q15366 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.812e-11■■■■■ 57.8
PCBP2Q15366 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.832e-11■■■■■ 57.8
PCBP2Q15366 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.43e-8■■■■■ 57.8
PCBP2Q15366 PCBP2-224ENST00000552980 527 ntTSL 34.05□□□□□ -1.762e-45■■■■■ 57.7
PCBP2Q15366 CREBBP-218ENST00000636895 100 ntTSL 51.19□□□□□ -2.225e-14■■■■■ 57.7
PCBP2Q15366 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.275e-12■■■■■ 57.6
PCBP2Q15366 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.165e-12■■■■■ 57.6
PCBP2Q15366 KANSL1-223ENST00000639150 1815 ntTSL 516.23■□□□□ 0.197e-8■■■■■ 57.6
PCBP2Q15366 KANSL1-203ENST00000571698 2276 ntTSL 515.06■□□□□ 07e-8■■■■■ 57.6
PCBP2Q15366 KANSL1-226ENST00000639375 3392 ntTSL 59.26□□□□□ -0.937e-8■■■■■ 57.6
PCBP2Q15366 SERPINA3-205ENST00000485588 575 ntTSL 1 (best)8.54□□□□□ -1.046e-22■■■■■ 57.6
PCBP2Q15366 CNNM1-202ENST00000488090 618 ntTSL 26.57□□□□□ -1.361e-13■■■■■ 57.5
PCBP2Q15366 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 510.43□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 57.5
PCBP2Q15366 CHFR-214ENST00000536932 584 ntTSL 414.51□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 57.4
PCBP2Q15366 ZNF605-201ENST00000331711 838 ntTSL 213.78□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 57.4
PCBP2Q15366 ZNF605-203ENST00000381215 1143 ntTSL 1 (best)9.58□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 57.4
PCBP2Q15366 ZNF605-205ENST00000412621 541 ntTSL 49.28□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 57.4
PCBP2Q15366 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 57.4
PCBP2Q15366 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.44e-7■■■■■ 57.4
PCBP2Q15366 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 57.4
PCBP2Q15366 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 57.4
PCBP2Q15366 MIR3142HG-201ENST00000517927 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.672e-12■■■■■ 57.4
PCBP2Q15366 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.149e-7■■■■■ 57.1
PCBP2Q15366 GPBP1-209ENST00000515484 962 ntTSL 25.49□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 57.1
PCBP2Q15366 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.761e-7■■■■■ 57.1
PCBP2Q15366 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.74□□□□□ -0.214e-20■■■■■ 57.1
PCBP2Q15366 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.84e-20■■■■■ 57.1
PCBP2Q15366 GATAD2A-210ENST00000457895 729 ntTSL 220.75■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 57
PCBP2Q15366 GATAD2A-212ENST00000494516 640 ntTSL 218.99■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 57
PCBP2Q15366 GATAD2A-213ENST00000609040 1652 ntTSL 218.86■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 57
PCBP2Q15366 GATAD2A-204ENST00000417582 655 ntTSL 218.75■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 57
PCBP2Q15366 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 57
PCBP2Q15366 LINC01572-201ENST00000561611 2194 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.034e-8■■■■■ 57
PCBP2Q15366 LINC01572-202ENST00000563770 568 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.074e-8■■■■■ 57
PCBP2Q15366 LINC01572-203ENST00000563823 563 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.174e-8■■■■■ 57
PCBP2Q15366 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.214e-8■■■■■ 57
PCBP2Q15366 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.474e-8■■■■■ 57
PCBP2Q15366 FYN-206ENST00000462598 825 ntTSL 512.13□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 57
PCBP2Q15366 FYN-203ENST00000368667 2416 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 57
PCBP2Q15366 FYN-220ENST00000518630 571 ntTSL 59.05□□□□□ -0.963e-7■■■■■ 57
PCBP2Q15366 FYN-227ENST00000523574 569 ntTSL 48.9□□□□□ -0.983e-7■■■■■ 57
PCBP2Q15366 FYN-222ENST00000521062 609 ntTSL 48.9□□□□□ -0.983e-7■■■■■ 57
PCBP2Q15366 FYN-226ENST00000523570 597 ntTSL 56.56□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 57
PCBP2Q15366 FYN-213ENST00000487824 518 ntTSL 56.56□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 57
PCBP2Q15366 FYN-228ENST00000524310 541 ntTSL 46.56□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 57
PCBP2Q15366 FYN-223ENST00000521361 723 ntTSL 46.12□□□□□ -1.433e-7■■■■■ 57
PCBP2Q15366 ST7-215ENST00000438863 1005 ntTSL 524.55■■□□□ 1.523e-6■■■■■ 57
PCBP2Q15366 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 57
PCBP2Q15366 ST7-OT4-202ENST00000397751 754 ntTSL 39.09□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 57
PCBP2Q15366 ST7-216ENST00000443979 805 ntTSL 57.19□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 57
PCBP2Q15366 ST7-211ENST00000421345 531 ntTSL 44.66□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 57
PCBP2Q15366 ST7-209ENST00000417919 577 ntTSL 44.59□□□□□ -1.673e-6■■■■■ 57
PCBP2Q15366 ST7-OT4-204ENST00000470996 416 ntTSL 24.5□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 57
PCBP2Q15366 ST7-OT4-205ENST00000471110 591 ntTSL 44.47□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 57
PCBP2Q15366 VLDLR-201ENST00000382096 736 ntTSL 520.9■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 57
PCBP2Q15366 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 57
PCBP2Q15366 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.752e-11■■■■■ 57
PCBP2Q15366 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.382e-11■■■■■ 57
PCBP2Q15366 TMEM243-206ENST00000474074 1031 ntTSL 214.42□□□□□ -0.12e-11■■■■■ 57
PCBP2Q15366 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.342e-11■■■■■ 57
PCBP2Q15366 TMEM243-207ENST00000481425 497 ntTSL 34.57□□□□□ -1.682e-11■■■■■ 57
PCBP2Q15366 MEMO1-205ENST00000413686 769 ntTSL 314.74□□□□□ -0.053e-8■■■■■ 56.9
PCBP2Q15366 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.293e-8■■■■■ 56.9
PCBP2Q15366 MEMO1-209ENST00000490459 1242 ntTSL 213.27□□□□□ -0.293e-8■■■■■ 56.9
PCBP2Q15366 MEMO1-201ENST00000295065 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.533e-8■■■■■ 56.9
PCBP2Q15366 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.693e-8■■■■■ 56.9
PCBP2Q15366 MEMO1-203ENST00000404530 1482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.163e-8■■■■■ 56.9
PCBP2Q15366 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.955e-13■■■■■ 56.9
PCBP2Q15366 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.585e-13■■■■■ 56.9
PCBP2Q15366 TMEM8B-205ENST00000464519 681 ntTSL 317.78■□□□□ 0.445e-13■■■■■ 56.9
PCBP2Q15366 TMEM8B-207ENST00000473947 999 ntTSL 517.7■□□□□ 0.425e-13■■■■■ 56.9
PCBP2Q15366 TMEM8B-208ENST00000490199 936 ntTSL 314.45□□□□□ -0.15e-13■■■■■ 56.9
PCBP2Q15366 TMEM8B-206ENST00000472010 964 ntTSL 313.55□□□□□ -0.245e-13■■■■■ 56.9
PCBP2Q15366 TMEM8B-201ENST00000377988 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.655e-13■■■■■ 56.9
PCBP2Q15366 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.415e-13■■■■■ 56.9
PCBP2Q15366 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 56.7
PCBP2Q15366 SAR1A-203ENST00000373239 468 ntTSL 312.93□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 56.7
PCBP2Q15366 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -12e-7■■■■■ 56.7
PCBP2Q15366 SHANK2-213ENST00000460048 736 ntTSL 515.46■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 56.7
PCBP2Q15366 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 56.6
PCBP2Q15366 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.033e-14■■■■■ 56.6
PCBP2Q15366 ANXA5-206ENST00000511552 1036 ntTSL 320.6■□□□□ 0.893e-14■■■■■ 56.6
PCBP2Q15366 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.283e-14■■■■■ 56.6
PCBP2Q15366 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.323e-14■■■■■ 56.6
PCBP2Q15366 ANXA5-203ENST00000506395 1606 ntTSL 511.97□□□□□ -0.493e-14■■■■■ 56.6
PCBP2Q15366 ANXA5-205ENST00000509648 1083 ntTSL 23.81□□□□□ -1.83e-14■■■■■ 56.6
PCBP2Q15366 EHMT1-219ENST00000626066 1297 ntTSL 515.88■□□□□ 0.138e-9■■■■■ 56.6
PCBP2Q15366 EHMT1-250ENST00000637977 2167 ntTSL 515.45■□□□□ 0.068e-9■■■■■ 56.6
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 267.5 ms