Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hif3aQ0VBL6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hif3aQ0VBL6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hif3aQ0VBL6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hif3aQ0VBL6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hif3aQ0VBL6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms