Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Hif3aQ0VBL6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Hif3aQ0VBL6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Hif3aQ0VBL6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Hif3aQ0VBL6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Hif3aQ0VBL6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Hif3aQ0VBL6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Hif3aQ0VBL6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Hif3aQ0VBL6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Hif3aQ0VBL6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Hif3aQ0VBL6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Hif3aQ0VBL6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hif3aQ0VBL6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Hif3aQ0VBL6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Hif3aQ0VBL6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Hif3aQ0VBL6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Hif3aQ0VBL6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Hif3aQ0VBL6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hif3aQ0VBL6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hif3aQ0VBL6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hif3aQ0VBL6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hif3aQ0VBL6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Hif3aQ0VBL6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Hif3aQ0VBL6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Hif3aQ0VBL6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hif3aQ0VBL6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hif3aQ0VBL6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hif3aQ0VBL6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Hif3aQ0VBL6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hif3aQ0VBL6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hif3aQ0VBL6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Hif3aQ0VBL6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hif3aQ0VBL6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hif3aQ0VBL6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Hif3aQ0VBL6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hif3aQ0VBL6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hif3aQ0VBL6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Hif3aQ0VBL6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hif3aQ0VBL6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hif3aQ0VBL6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hif3aQ0VBL6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hif3aQ0VBL6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hif3aQ0VBL6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hif3aQ0VBL6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hif3aQ0VBL6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hif3aQ0VBL6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Hif3aQ0VBL6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hif3aQ0VBL6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hif3aQ0VBL6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hif3aQ0VBL6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hif3aQ0VBL6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Hif3aQ0VBL6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hif3aQ0VBL6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hif3aQ0VBL6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hif3aQ0VBL6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hif3aQ0VBL6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hif3aQ0VBL6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hif3aQ0VBL6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Hif3aQ0VBL6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hif3aQ0VBL6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hif3aQ0VBL6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hif3aQ0VBL6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hif3aQ0VBL6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hif3aQ0VBL6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hif3aQ0VBL6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Hif3aQ0VBL6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hif3aQ0VBL6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hif3aQ0VBL6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hif3aQ0VBL6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hif3aQ0VBL6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hif3aQ0VBL6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hif3aQ0VBL6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hif3aQ0VBL6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hif3aQ0VBL6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hif3aQ0VBL6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Hif3aQ0VBL6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hif3aQ0VBL6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hif3aQ0VBL6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hif3aQ0VBL6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hif3aQ0VBL6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hif3aQ0VBL6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Hif3aQ0VBL6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hif3aQ0VBL6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hif3aQ0VBL6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hif3aQ0VBL6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hif3aQ0VBL6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hif3aQ0VBL6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hif3aQ0VBL6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hif3aQ0VBL6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hif3aQ0VBL6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hif3aQ0VBL6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hif3aQ0VBL6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hif3aQ0VBL6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hif3aQ0VBL6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Hif3aQ0VBL6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Hif3aQ0VBL6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hif3aQ0VBL6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hif3aQ0VBL6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hif3aQ0VBL6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms