Protein–RNA interactions for Protein: Q08412

CUE5, Ubiquitin-binding protein CUE5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE5Q08412 SSC1YJR045C 1965 nt6.85□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 TOS2YGR221C 1869 nt6.85□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 MPA43YNL249C 1629 nt6.84□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 YLL066CYLL066C 3618 nt6.84□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 HED1YDR014W-A 489 nt6.84□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 YSC83YHR017W 1158 nt6.84□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 RMA1YKL132C 1293 nt6.84□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 SLA2YNL243W 2907 nt6.84□□□□□ -1.31
CUE5Q08412 HSM3YBR272C 1443 nt6.84□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 YOR389WYOR389W 1875 nt6.83□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 PPH22YDL188C 1134 nt6.83□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 AGX1YFL030W 1158 nt6.83□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 MCP1YOR228C 909 nt6.83□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 LGE1YPL055C 999 nt6.83□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 RPL5YPL131W 894 nt6.83□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 NUP49YGL172W 1419 nt6.83□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 PEX31YGR004W 1389 nt6.82□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 OPI11YPR044C 354 nt6.82□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 MKK1YOR231W 1527 nt6.81□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 GAA1YLR088W 1845 nt6.81□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 DYS1YHR068W 1164 nt6.81□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 COS10YNR075W 1125 nt6.81□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 IRC11YOR013W 471 nt6.81□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 SPE3YPR069C 882 nt6.81□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 AGP2YBR132C 1791 nt6.81□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 YHR020WYHR020W 2067 nt6.81□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 GYP8YFL027C 1494 nt6.8□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 PPM2YOL141W 2088 nt6.8□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 FCY22YER060W-A 1593 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 PPH21YDL134C 1110 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 GCN3YKR026C 918 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 TMA46YOR091W 1038 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 SPS22YCL048W 1392 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 DOT1YDR440W 1749 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 ATG36YJL185C 882 nt6.78□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 LDB7YBL006C 543 nt6.78□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 YBL070CYBL070C 321 nt6.78□□□□□ -1.32
CUE5Q08412 YJR107WYJR107W 987 nt6.77□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.77□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 URA1YKL216W 945 nt6.77□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 MEU1YLR017W 1014 nt6.77□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 YNL092WYNL092W 1203 nt6.77□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 TOS6YNL300W 309 nt6.77□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 ADH5YBR145W 1056 nt6.77□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 YFL052WYFL052W 1398 nt6.77□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 STT3YGL022W 2157 nt6.76□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 BIO3YNR058W 1443 nt6.76□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 OPI8YKR035C 642 nt6.76□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 SWD1YAR003W 1281 nt6.76□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 RRN10YBL025W 438 nt6.76□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 SMK1YPR054W 1167 nt6.76□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 CMR1YDL156W 1569 nt6.76□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 OPT1YJL212C 2400 nt6.76□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 YDR415CYDR415C 1125 nt6.75□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 ASR1YPR093C 867 nt6.75□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 SGE1YPR198W 1632 nt6.75□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 COQ1YBR003W 1422 nt6.75□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 MPH3YJR160C 1809 nt6.74□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 MIP1YOR330C 3765 nt6.74□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 HMS2YJR147W 1077 nt6.74□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 CUE4YML101C 354 nt6.74□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 TFC6YDR362C 2019 nt6.74□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 ACO1YLR304C 2337 nt6.73□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 HEM1YDR232W 1647 nt6.73□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 YPT1YFL038C 621 nt6.73□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 COG1YGL223C 1254 nt6.73□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 AAD14YNL331C 1131 nt6.73□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 EDE1YBL047C 4146 nt6.73□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 RSC2YLR357W 2670 nt6.73□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 COX15YER141W 1461 nt6.73□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 HIS1YER055C 894 nt6.72□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 HSP12YFL014W 330 nt6.72□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 YJL144WYJL144W 315 nt6.72□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 HOC1YJR075W 1191 nt6.72□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 GUF1YLR289W 1938 nt6.72□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 FMP40YPL222W 2067 nt6.72□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 ELP3YPL086C 1674 nt6.71□□□□□ -1.33
CUE5Q08412 CDC11YJR076C 1248 nt6.71□□□□□ -1.34
CUE5Q08412 YKL102CYKL102C 306 nt6.71□□□□□ -1.34
CUE5Q08412 YKR032WYKR032W 315 nt6.71□□□□□ -1.34
CUE5Q08412 PLB3YOL011W 2061 nt6.71□□□□□ -1.34
CUE5Q08412 ECM38YLR299W 1983 nt6.71□□□□□ -1.34
CUE5Q08412 YKL077WYKL077W 1179 nt6.7□□□□□ -1.34
CUE5Q08412 VTS1YOR359W 1572 nt6.69□□□□□ -1.34
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