Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SeleQ00690 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SeleQ00690 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SeleQ00690 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SeleQ00690 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SeleQ00690 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SeleQ00690 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SeleQ00690 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SeleQ00690 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SeleQ00690 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms