Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SeleQ00690 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SeleQ00690 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SeleQ00690 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SeleQ00690 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SeleQ00690 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SeleQ00690 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SeleQ00690 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SeleQ00690 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SeleQ00690 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SeleQ00690 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SeleQ00690 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SeleQ00690 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SeleQ00690 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SeleQ00690 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SeleQ00690 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SeleQ00690 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SeleQ00690 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SeleQ00690 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SeleQ00690 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SeleQ00690 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SeleQ00690 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SeleQ00690 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SeleQ00690 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SeleQ00690 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SeleQ00690 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SeleQ00690 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SeleQ00690 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SeleQ00690 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SeleQ00690 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SeleQ00690 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SeleQ00690 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SeleQ00690 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SeleQ00690 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SeleQ00690 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SeleQ00690 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SeleQ00690 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SeleQ00690 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SeleQ00690 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SeleQ00690 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SeleQ00690 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SeleQ00690 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SeleQ00690 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SeleQ00690 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SeleQ00690 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SeleQ00690 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SeleQ00690 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SeleQ00690 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SeleQ00690 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SeleQ00690 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SeleQ00690 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SeleQ00690 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SeleQ00690 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SeleQ00690 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SeleQ00690 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SeleQ00690 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SeleQ00690 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SeleQ00690 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SeleQ00690 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SeleQ00690 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SeleQ00690 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SeleQ00690 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SeleQ00690 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SeleQ00690 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SeleQ00690 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SeleQ00690 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SeleQ00690 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SeleQ00690 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SeleQ00690 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SeleQ00690 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SeleQ00690 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SeleQ00690 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SeleQ00690 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SeleQ00690 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SeleQ00690 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SeleQ00690 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SeleQ00690 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SeleQ00690 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SeleQ00690 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SeleQ00690 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SeleQ00690 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SeleQ00690 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SeleQ00690 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SeleQ00690 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SeleQ00690 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SeleQ00690 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SeleQ00690 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SeleQ00690 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SeleQ00690 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SeleQ00690 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SeleQ00690 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SeleQ00690 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SeleQ00690 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SeleQ00690 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SeleQ00690 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SeleQ00690 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SeleQ00690 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SeleQ00690 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SeleQ00690 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SeleQ00690 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms