Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gfra1P97785 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gfra1P97785 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra1P97785 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms