Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgf11P70378 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fgf11P70378 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fgf11P70378 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgf11P70378 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgf11P70378 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgf11P70378 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgf11P70378 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgf11P70378 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgf11P70378 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgf11P70378 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgf11P70378 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms