Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacnb3P54285 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacnb3P54285 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacnb3P54285 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cacnb3P54285 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacnb3P54285 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms