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Protein–RNA interactions for Protein: P40077
DSE1, Protein DSE1, yeast
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573 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
DSE1
P40077
SPG1
YGR236C
288 nt
6.91
□□□□□ -1.3
DSE1
P40077
YHR213W-B
YHR213W-B
300 nt
6.91
□□□□□ -1.3
DSE1
P40077
YAR064W
YAR064W
300 nt
6.91
□□□□□ -1.3
DSE1
P40077
ACO1
YLR304C
2337 nt
6.91
□□□□□ -1.3
DSE1
P40077
YHK8
YHR048W
1545 nt
6.91
□□□□□ -1.3
DSE1
P40077
OSW2
YLR054C
2175 nt
6.91
□□□□□ -1.3
DSE1
P40077
EDC3
YEL015W
1656 nt
6.9
□□□□□ -1.3
DSE1
P40077
HIS1
YER055C
894 nt
6.9
□□□□□ -1.3
DSE1
P40077
ATG36
YJL185C
882 nt
6.9
□□□□□ -1.3
DSE1
P40077
DRE2
YKR071C
1047 nt
6.9
□□□□□ -1.3
DSE1
P40077
MHT1
YLL062C
975 nt
6.9
□□□□□ -1.3
DSE1
P40077
TSR2
YLR435W
618 nt
6.9
□□□□□ -1.3
DSE1
P40077
YHR131C
YHR131C
2553 nt
6.89
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
YKR045C
YKR045C
552 nt
6.89
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
RDN5-2
RDN5-2
119 nt
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□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
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RDN5-3
119 nt
6.89
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
RDN5-4
RDN5-4
119 nt
6.89
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
RDN5-5
RDN5-5
119 nt
6.89
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
IMD1
YAR073W
1212 nt
6.89
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
ARC35
YNR035C
1029 nt
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□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
SMK1
YPR054W
1167 nt
6.89
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
GPD2
YOL059W
1323 nt
6.89
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
CBK1
YNL161W
2271 nt
6.88
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
SKY1
YMR216C
2229 nt
6.88
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
YJL045W
YJL045W
1905 nt
6.88
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
ERS1
YCR075C
783 nt
6.88
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
YBR027C
YBR027C
333 nt
6.88
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
TAH11
YJR046W
1815 nt
6.87
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
COX10
YPL172C
1389 nt
6.87
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
NAS6
YGR232W
687 nt
6.87
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
YDR187C
YDR187C
519 nt
6.86
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
YFL013W-A
YFL013W-A
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6.86
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
ECM27
YJR106W
2178 nt
6.86
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
YEL023C
YEL023C
2049 nt
6.86
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
CDC1
YDR182W
1476 nt
6.85
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
TAE1
YBR261C
699 nt
6.85
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
YBR241C
YBR241C
1467 nt
6.85
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
RGD2
YFL047W
2145 nt
6.85
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
UIP5
YKR044W
1332 nt
6.84
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
TFG2
YGR005C
1203 nt
6.84
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
MGM101
YJR144W
810 nt
6.84
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
IRC11
YOR013W
471 nt
6.84
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
CCT8
YJL008C
1707 nt
6.84
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
RRP9
YPR137W
1722 nt
6.84
□□□□□ -1.31
DSE1
P40077
ECM38
YLR299W
1983 nt
6.84
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
VMA3
YEL027W
483 nt
6.83
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
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YEL075W-A
612 nt
6.83
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
TDH2
YJR009C
999 nt
6.83
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
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YLR463C
552 nt
6.83
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
YMR122C
YMR122C
375 nt
6.83
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
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YNR014W
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6.83
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
HBN1
YCL026C-B
582 nt
6.83
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
STT3
YGL022W
2157 nt
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□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
FYV1
YDR024W
486 nt
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□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
CUP2
YGL166W
678 nt
6.82
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
RRN10
YBL025W
438 nt
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□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
RFC4
YOL094C
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6.82
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
BDF2
YDL070W
1917 nt
6.82
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
MLS1
YNL117W
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6.81
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
tG(GCC)B
tG(GCC)B
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6.81
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DSE1
P40077
SUF16
tG(GCC)C
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6.81
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
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tG(GCC)D1
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6.81
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
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tG(GCC)D2
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6.81
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DSE1
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tG(GCC)E
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DSE1
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SUF20
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DSE1
P40077
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6.81
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DSE1
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tG(GCC)G1
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6.81
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DSE1
P40077
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tG(GCC)G2
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6.81
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
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tG(GCC)J1
71 nt
6.81
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
SUF23
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6.81
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
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tG(GCC)M
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6.81
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
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tG(GCC)O1
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6.81
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
SUF17
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□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
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tG(GCC)P1
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6.81
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
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tG(GCC)P2
71 nt
6.81
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
CTF19
YPL018W
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P40077
ZWF1
YNL241C
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DSE1
P40077
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YPR204W
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□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
MPC2
YHR162W
390 nt
6.79
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
YJR146W
YJR146W
354 nt
6.79
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
DID2
YKR035W-A
615 nt
6.79
□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
OGG1
YML060W
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□□□□□ -1.32
DSE1
P40077
ECM30
YLR436C
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DSE1
P40077
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YMR279C
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DSE1
P40077
FAL1
YDR021W
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DSE1
P40077
HSP12
YFL014W
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P40077
LYS1
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P40077
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YML018C
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DSE1
P40077
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YNL024C-A
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DSE1
P40077
RUF23
RUF23
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□□□□□ -1.33
DSE1
P40077
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□□□□□ -1.33
DSE1
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□□□□□ -1.33
DSE1
P40077
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DSE1
P40077
PPH22
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DSE1
P40077
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P40077
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DSE1
P40077
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P40077
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□□□□□ -1.33
DSE1
P40077
YMR295C
YMR295C
594 nt
6.75
□□□□□ -1.33
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