Protein–RNA interactions for Protein: P38915

SPT8, Transcription factor SPT8, yeastyeast

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT8P38915 COQ1YBR003W 1422 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 DYS1YHR068W 1164 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 DOT1YDR440W 1749 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT8P38915 YPR204WYPR204W 3099 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT8P38915 AGX1YFL030W 1158 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT8P38915 ASR1YPR093C 867 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT8P38915 YKL077WYKL077W 1179 nt7.27□□□□□ -1.25
SPT8P38915 MRPL19YNL185C 477 nt7.27□□□□□ -1.25
SPT8P38915 TOS6YNL300W 309 nt7.27□□□□□ -1.25
SPT8P38915 LGE1YPL055C 999 nt7.27□□□□□ -1.25
SPT8P38915 PPH21YDL134C 1110 nt7.26□□□□□ -1.25
SPT8P38915 HED1YDR014W-A 489 nt7.26□□□□□ -1.25
SPT8P38915 GTT3YEL017W 1014 nt7.26□□□□□ -1.25
SPT8P38915 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.26□□□□□ -1.25
SPT8P38915 URA1YKL216W 945 nt7.26□□□□□ -1.25
SPT8P38915 YKR032WYKR032W 315 nt7.26□□□□□ -1.25
SPT8P38915 YBR113WYBR113W 483 nt7.26□□□□□ -1.25
SPT8P38915 PPM2YOL141W 2088 nt7.26□□□□□ -1.25
SPT8P38915 GPA1YHR005C 1419 nt7.26□□□□□ -1.25
SPT8P38915 MIA40YKL195W 1212 nt7.25□□□□□ -1.25
SPT8P38915 PHO3YBR092C 1404 nt7.25□□□□□ -1.25
SPT8P38915 HEM1YDR232W 1647 nt7.24□□□□□ -1.25
SPT8P38915 YDR415CYDR415C 1125 nt7.24□□□□□ -1.25
SPT8P38915 YJR107WYJR107W 987 nt7.23□□□□□ -1.25
SPT8P38915 YKR023WYKR023W 1593 nt7.23□□□□□ -1.25
SPT8P38915 MPH3YJR160C 1809 nt7.22□□□□□ -1.25
SPT8P38915 RBS1YDL189W 1374 nt7.22□□□□□ -1.25
SPT8P38915 HEM2YGL040C 1029 nt7.22□□□□□ -1.25
SPT8P38915 YHC3YJL059W 1227 nt7.22□□□□□ -1.25
SPT8P38915 HMS2YJR147W 1077 nt7.22□□□□□ -1.25
SPT8P38915 DID2YKR035W-A 615 nt7.22□□□□□ -1.25
SPT8P38915 AAD14YNL331C 1131 nt7.22□□□□□ -1.25
SPT8P38915 ADE17YMR120C 1779 nt7.22□□□□□ -1.25
SPT8P38915 BIO3YNR058W 1443 nt7.21□□□□□ -1.25
SPT8P38915 YPT1YFL038C 621 nt7.21□□□□□ -1.26
SPT8P38915 YJL144WYJL144W 315 nt7.21□□□□□ -1.26
SPT8P38915 CUE4YML101C 354 nt7.21□□□□□ -1.26
SPT8P38915 PRP2YNR011C 2631 nt7.21□□□□□ -1.26
SPT8P38915 PMT3YOR321W 2262 nt7.21□□□□□ -1.26
SPT8P38915 COX10YPL172C 1389 nt7.2□□□□□ -1.26
SPT8P38915 HGH1YGR187C 1185 nt7.2□□□□□ -1.26
SPT8P38915 LDB7YBL006C 543 nt7.2□□□□□ -1.26
SPT8P38915 MRPL23YOR150W 492 nt7.2□□□□□ -1.26
SPT8P38915 YOR300WYOR300W 309 nt7.2□□□□□ -1.26
SPT8P38915 ADH5YBR145W 1056 nt7.2□□□□□ -1.26
SPT8P38915 CRH1YGR189C 1524 nt7.2□□□□□ -1.26
SPT8P38915 SGV1YPR161C 1974 nt7.2□□□□□ -1.26
SPT8P38915 NTE1YML059C 5040 nt7.2□□□□□ -1.26
SPT8P38915 EDE1YBL047C 4146 nt7.2□□□□□ -1.26
SPT8P38915 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.19□□□□□ -1.26
SPT8P38915 RFC4YOL094C 972 nt7.19□□□□□ -1.26
SPT8P38915 SPE3YPR069C 882 nt7.19□□□□□ -1.26
SPT8P38915 FMP40YPL222W 2067 nt7.19□□□□□ -1.26
SPT8P38915 NMD5YJR132W 3147 nt7.19□□□□□ -1.26
SPT8P38915 ATG36YJL185C 882 nt7.18□□□□□ -1.26
SPT8P38915 HOC1YJR075W 1191 nt7.17□□□□□ -1.26
SPT8P38915 FBA1YKL060C 1080 nt7.17□□□□□ -1.26
SPT8P38915 RNH1YMR234W 1047 nt7.17□□□□□ -1.26
SPT8P38915 COX5AYNL052W 462 nt7.17□□□□□ -1.26
SPT8P38915 YNL092WYNL092W 1203 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT8P38915 PUS4YNL292W 1212 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT8P38915 RGT2YDL138W 2292 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT8P38915 ARG81YML099C 2643 nt7.15□□□□□ -1.26
SPT8P38915 KNS1YLL019C 2214 nt7.15□□□□□ -1.26
SPT8P38915 TPK1YJL164C 1194 nt7.15□□□□□ -1.26
SPT8P38915 YNL120CYNL120C 486 nt7.15□□□□□ -1.26
SPT8P38915 YNL200CYNL200C 741 nt7.15□□□□□ -1.26
SPT8P38915 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.15□□□□□ -1.26
SPT8P38915 YPL257WYPL257W 582 nt7.15□□□□□ -1.26
SPT8P38915 VMA2YBR127C 1554 nt7.15□□□□□ -1.27
SPT8P38915 AVT4YNL101W 2142 nt7.15□□□□□ -1.27
SPT8P38915 ISC1YER019W 1434 nt7.14□□□□□ -1.27
SPT8P38915 YHK8YHR048W 1545 nt7.14□□□□□ -1.27
SPT8P38915 FMO1YHR176W 1299 nt7.14□□□□□ -1.27
SPT8P38915 ASF1YJL115W 840 nt7.14□□□□□ -1.27
SPT8P38915 LIA1YJR070C 978 nt7.14□□□□□ -1.27
SPT8P38915 YJR146WYJR146W 354 nt7.14□□□□□ -1.27
SPT8P38915 YLR312CYLR312C 1197 nt7.14□□□□□ -1.27
SPT8P38915 LSC1YOR142W 990 nt7.14□□□□□ -1.27
SPT8P38915 THI2YBR240C 1353 nt7.14□□□□□ -1.27
SPT8P38915 MSY1YPL097W 1479 nt7.13□□□□□ -1.27
SPT8P38915 SES1YDR023W 1389 nt7.13□□□□□ -1.27
SPT8P38915 SQT1YIR012W 1296 nt7.13□□□□□ -1.27
SPT8P38915 YUR1YJL139C 1287 nt7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 74.5 ms