Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sftpa1P35242 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sftpa1P35242 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sftpa1P35242 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sftpa1P35242 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sftpa1P35242 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms