Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cdk11bP24788 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cdk11bP24788 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Cdk11bP24788 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Cdk11bP24788 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cdk11bP24788 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Cdk11bP24788 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cdk11bP24788 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cdk11bP24788 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Cdk11bP24788 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cdk11bP24788 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Cdk11bP24788 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Cdk11bP24788 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cdk11bP24788 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Cdk11bP24788 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cdk11bP24788 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cdk11bP24788 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Cdk11bP24788 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cdk11bP24788 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Cdk11bP24788 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cdk11bP24788 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Cdk11bP24788 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Cdk11bP24788 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdk11bP24788 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdk11bP24788 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdk11bP24788 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdk11bP24788 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdk11bP24788 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdk11bP24788 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cdk11bP24788 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms