Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm3542K7N6U2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3542K7N6U2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3542K7N6U2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3542K7N6U2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3542K7N6U2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms