Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nccrp1G3X9C2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nccrp1G3X9C2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nccrp1G3X9C2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms