Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Soga1E1U8D0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
Soga1E1U8D0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Soga1E1U8D0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Soga1E1U8D0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Soga1E1U8D0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Soga1E1U8D0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Soga1E1U8D0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms