Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Odf2A3KGV1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Odf2A3KGV1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Odf2A3KGV1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms