Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga8A2ARA8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga8A2ARA8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms