Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCQ6

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YCQ6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A286YCQ6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A286YCQ6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A286YCQ6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A286YCQ6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A286YCQ6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A286YCQ6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A286YCQ6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A286YCQ6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A286YCQ6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A286YCQ6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A286YCQ6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A286YCQ6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms