Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dctn3Q9Z0Y1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dctn3Q9Z0Y1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dctn3Q9Z0Y1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dctn3Q9Z0Y1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dctn3Q9Z0Y1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dctn3Q9Z0Y1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dctn3Q9Z0Y1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dctn3Q9Z0Y1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dctn3Q9Z0Y1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dctn3Q9Z0Y1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dctn3Q9Z0Y1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dctn3Q9Z0Y1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms