Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0X0

Cdc42ep5, Cdc42 effector protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep5Q9Z0X0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdc42ep5Q9Z0X0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42ep5Q9Z0X0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdc42ep5Q9Z0X0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdc42ep5Q9Z0X0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms