Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP5

Cdh22, Cadherin-22, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh22Q9WTP5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh22Q9WTP5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh22Q9WTP5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh22Q9WTP5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms