Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hsf4Q9R0L1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hsf4Q9R0L1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hsf4Q9R0L1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms